الجامعات الحكومية تعتمد على دعم الدولة، لذلك تكون تكلفتها منخفضة جدًا أو مجانية، بينما الجامعات الأهلية تحتاج إلى رسوم دراسية أعلى.

من ناحية القبول، الجامعات الحكومية تكون أكثر تنافسية وتحتاج إلى درجات مرتفعة، أما الجامعات الأهلية فتكون أكثر مرونة في شروط القبول.

كذلك تختلف أعداد الطلاب، حيث تضم الجامعات الحكومية أعدادًا كبيرة، بينما توفر الجامعات الأهلية فصولًا أقل وعددًا أقل من الطلاب مما يساعد على متابعة أفضل.

في جودة التعليم، الجامعات الحكومية تمتلك سمعة قوية وخبرة طويلة، بينما تركز بعض الجامعات الأهلية على المناهج الحديثة والتطبيق العملي.